17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5143 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5143  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5232  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157078  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5524  hypothetical protein  96.04 
 
 
278 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5749  hypothetical protein  55.68 
 
 
322 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.98914  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1074  hypothetical protein  48.45 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5024  hypothetical protein  41.03 
 
 
305 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2713  hypothetical protein  39.02 
 
 
304 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0780  hypothetical protein  37.89 
 
 
309 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0042444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0835  hypothetical protein  37.89 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0249958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3869  hypothetical protein  34.69 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36990  hypothetical protein  40.46 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0292206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0516  hypothetical protein  35.52 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00149183  hitchhiker  0.00000250398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3102  hypothetical protein  37.42 
 
 
294 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.121827  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1552  hypothetical protein  37.75 
 
 
302 aa  63.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390785  normal  0.414185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3395  hypothetical protein  43.96 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.462422  normal  0.846133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0874  hypothetical protein  41.6 
 
 
344 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0132843  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0838  hypothetical protein  31.78 
 
 
340 aa  52.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.145329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>