38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34000 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34000  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0485  hypothetical protein  65.24 
 
 		 308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1712  hypothetical protein  54.2 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.986402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4728  hypothetical protein  50.36 
 
 		 407 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5039  hypothetical protein  52.1 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10894  hypothetical protein  52.99 
 
 		 262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00892613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0414  hypothetical protein  51.35 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0502  hypothetical protein  54.65 
 
 		 279 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498242  decreased coverage  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4854  hypothetical protein  51.28 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0646326 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4558  hypothetical protein  51.28 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0576894 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4471  hypothetical protein  51.28 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0815  hypothetical protein  53.04 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5856  hypothetical protein  49.79 
 
 		 492 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3581  hypothetical protein  52.1 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211852  normal  0.13972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0235  hypothetical protein  47.06 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0819  hypothetical protein  49 
 
 		 256 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4184  hypothetical protein  47.06 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.134001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0829  hypothetical protein  51.3 
 
 		 242 aa  218  7.999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3293  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.262546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8900  hypothetical protein  49.33 
 
 		 278 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0747  hypothetical protein  49.57 
 
 		 310 aa  211  2e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011814  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8087  hypothetical protein  48.26 
 
 		 343 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26190  hypothetical protein  45.42 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3930  hypothetical protein  48.95 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31380  hypothetical protein  43.48 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.56193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2929  hypothetical protein  47 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.490815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4418  hypothetical protein  46.89 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1239  hypothetical protein  43.5 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0967814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0154  hypothetical protein  44.64 
 
 		 411 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2046  hypothetical protein  44.31 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0108  hypothetical protein  50.51 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0849  hypothetical protein  45.93 
 
 		 303 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  decreased coverage  0.00865222 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0008  hypothetical protein  36.65 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0723  hypothetical protein  42.37 
 
 		 468 aa  93.2  6e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24100  hypothetical protein  46.46 
 
 		 240 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.909477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0909  hypothetical protein  38.52 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0791  hypothetical protein  42.11 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04170  hypothetical protein  43.66 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0243871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>