38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3930 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3930  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  528  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0819  hypothetical protein  55.7 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4184  hypothetical protein  52.36 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.134001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0235  hypothetical protein  50.79 
 
 		 272 aa  245  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8900  hypothetical protein  52.76 
 
 		 278 aa  238  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8087  hypothetical protein  52.59 
 
 		 343 aa  237  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0414  hypothetical protein  53.62 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.431973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4418  hypothetical protein  52.59 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.277724  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3293  hypothetical protein  56.9 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.262546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31380  hypothetical protein  50.66 
 
 		 338 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.56193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0747  hypothetical protein  50.4 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.011814  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0502  hypothetical protein  52 
 
 		 279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498242  decreased coverage  0.000751962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0485  hypothetical protein  51.3 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0815  hypothetical protein  53.04 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2929  hypothetical protein  49.19 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.490815  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34000  hypothetical protein  48.95 
 
 		 329 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.263655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3581  hypothetical protein  49.8 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211852  normal  0.13972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5856  hypothetical protein  49.58 
 
 		 492 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0108  hypothetical protein  53.36 
 
 		 357 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0154  hypothetical protein  50.42 
 
 		 411 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0849  hypothetical protein  52.36 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.478547  decreased coverage  0.00865222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2046  hypothetical protein  44.17 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26190  hypothetical protein  46.98 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.105599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4854  hypothetical protein  44.4 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0646326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4471  hypothetical protein  44.4 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4558  hypothetical protein  44.4 
 
 		 257 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0576894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5039  hypothetical protein  46 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1712  hypothetical protein  45.49 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.986402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1239  hypothetical protein  44.68 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0967814  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10894  hypothetical protein  44.68 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00892613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4728  hypothetical protein  44.35 
 
 		 407 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0829  hypothetical protein  42.86 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0008  hypothetical protein  37.96 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0723  hypothetical protein  30.86 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.193357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24100  hypothetical protein  47.86 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.909477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0909  hypothetical protein  50.51 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04170  hypothetical protein  59.7 
 
 		 167 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0243871  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0791  hypothetical protein  43.86 
 
 		 178 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>