42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  50 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  49.22 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  41.54 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  40.46 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  38.93 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  36.92 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1405  OsmC family protein  33.08 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.969301  normal  0.041582 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2351  OsmC family protein  30.08 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  36.23 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.6 
 
 		 171 aa  52  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  33.08 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  30.83 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1495  OsmC family protein  35.19 
 
 		 141 aa  50.4  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  30.3 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  28.23 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  28.57 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  29.77 
 
 		 153 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1268  OsmC-like protein protein  30.58 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3731  OsmC family protein  28.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.159888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  29.46 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0597  OsmC family protein  30.19 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  29.13 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5001  OsmC family protein  28.83 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000117697  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  29.01 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  31.97 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  30.91 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  27.69 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  26.92 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  27.69 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  26.92 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  26.92 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  29.58 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  31.36 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1163  OsmC family protein  28.72 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000507704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  29.03 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  29.03 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  25.98 
 
 		 138 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>