25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30670 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 
171 aa  336  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  66.67 
 
 
141 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  72.09 
 
 
153 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  68.7 
 
 
145 aa  177  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  68.46 
 
 
154 aa  175  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  67.44 
 
 
163 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  63.64 
 
 
137 aa  174  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  62.86 
 
 
141 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  62.86 
 
 
141 aa  173  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  62.86 
 
 
141 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  56.62 
 
 
146 aa  151  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  52.14 
 
 
164 aa  140  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  43.21 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  45.74 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  43.65 
 
 
154 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  35.88 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  33.83 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  34.03 
 
 
161 aa  54.7  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.6 
 
 
131 aa  52  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  34.92 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  29.32 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  38.14 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.85 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  31.75 
 
 
138 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3616  osmotically inducible protein  34.69 
 
 
129 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000818818  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>