24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1570 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  100 
 
 		 145 aa  285  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  80.43 
 
 		 153 aa  221  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  75.76 
 
 		 141 aa  204  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  73.28 
 
 		 163 aa  196  9e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  73.28 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  73.28 
 
 		 141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  70.99 
 
 		 137 aa  194  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  72.52 
 
 		 141 aa  194  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  68.7 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  58.7 
 
 		 164 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  57.75 
 
 		 154 aa  158  3e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  54.41 
 
 		 146 aa  146  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  48.12 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  40.94 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  40.16 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  34.33 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  33.33 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  35.88 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  36.89 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  39.83 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2694  OsmC family protein  32.48 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448513  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.08 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  30.94 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.38 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>