20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0403 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  100 
 
 		 139 aa  288  1e-77  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  57.97 
 
 		 137 aa  170  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  36.09 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  36.09 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  36.09 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  35.07 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  35.34 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  32.03 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.83 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  29.1 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  30.83 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  33.33 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  32.84 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  32.33 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  29.85 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.33 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  30.6 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  28.23 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  27.82 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  30.56 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>