23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1983 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1983  OsmC family protein  100 
 
 
146 aa  293  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30670  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  56.62 
 
 
171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1570  OsmC family protein  54.41 
 
 
145 aa  146  9e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00295172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2074  OsmC family protein  51.85 
 
 
153 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4190  OsmC family protein  52 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.708913  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12938  hypothetical protein  46.56 
 
 
137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0241589  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2173  OsmC family protein  48.85 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0784  OsmC family protein  48.84 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1931  OsmC family protein  47.2 
 
 
141 aa  120  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110591  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1951  OsmC-like protein  46.4 
 
 
141 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.466899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1997  OsmC family protein  46.4 
 
 
141 aa  120  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.608934  normal  0.376979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2855  OsmC family protein  46.28 
 
 
158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2839  OsmC family protein  42.22 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.23594  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0710  OsmC family protein  38.66 
 
 
154 aa  94  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16800  OsmC-like protein  37.68 
 
 
154 aa  93.2  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0440531  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1788  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0403  OsmC-like protein  32.84 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20740  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.23 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104919  normal  0.0981692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1018  OsmC family protein  38.66 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8006  OsmC family protein  30.95 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  29.23 
 
 
161 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14900  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.9 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136594  normal  0.328629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7915  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  29.75 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>