145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0397 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  278  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000792  OsmC/Ohr family protein  78.63 
 
 		 132 aa  226  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06689  hypothetical protein  77.86 
 
 		 136 aa  223  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2738  OsmC-like protein  72.52 
 
 		 133 aa  209  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  58.78 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  58.78 
 
 		 139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  58.02 
 
 		 134 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241703 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  168  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  58.33 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  58.78 
 
 		 134 aa  167  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  56.06 
 
 		 135 aa  167  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  56.06 
 
 		 135 aa  167  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  56.06 
 
 		 135 aa  166  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  58.33 
 
 		 135 aa  166  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  58.02 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  55.3 
 
 		 135 aa  163  6.9999999999999995e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  55.73 
 
 		 134 aa  161  3e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  56.49 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  51.15 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  46.32 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4022  OsmC-like protein  48.48 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  46.67 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  45.93 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  45.19 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  46.67 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  46.67 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  48.53 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  47.45 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  48.53 
 
 		 140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  48.53 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  45.8 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  49.26 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  45.99 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000203576  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  45 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  45 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  47.79 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  43.38 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  42.96 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  47.06 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1064  OsmC family protein  44.7 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.156075  normal  0.0776132 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  45.19 
 
 		 142 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  43.8 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  42.22 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  45.59 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  43.8 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  45.65 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  45.59 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  45.59 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  45.59 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  45.59 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  41.48 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  44.12 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  43.8 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000773894  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  46.88 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  43.07 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  45 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  43.07 
 
 		 148 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  42.34 
 
 		 140 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  40 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  41.61 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  42.45 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  42.34 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  42.34 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  42.34 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  43.07 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928304  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  41.61 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  44.96 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  42.34 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  41.61 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  41.61 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  41.61 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  42.34 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  39.1 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  41.61 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  42.34 
 
 		 140 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  42.34 
 
 		 140 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  41.84 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  40.41 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  43.9 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2326  OsmC family protein  42.42 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  40.41 
 
 		 149 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  38.78 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  39.46 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000158569  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  39.69 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  39.69 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  37.67 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  37.67 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  43.08 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1591  OsmC family protein  44.63 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277142  normal  0.616103 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  42.34 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200026  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  36.3 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>