29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19980  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  100 
 
 		 234 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00940514  hitchhiker  0.00120115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5545  hypothetical protein  56.47 
 
 		 253 aa  251  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1714  hypothetical protein  55.84 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1760  hypothetical protein  55.84 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1691  hypothetical protein  55.13 
 
 		 245 aa  244  9e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3426  hypothetical protein  54.15 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3489  hypothetical protein  54.15 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3437  hypothetical protein  54.15 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22330  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  41.78 
 
 		 284 aa  141  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1968  hypothetical protein  35.4 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736708  hitchhiker  0.000925089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  25.55 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  25.78 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  25.66 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  26.34 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  25.89 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  25.89 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  25.89 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  25.89 
 
 		 244 aa  85.1  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  25.78 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0158  hypothetical protein  30.48 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3061  hypothetical protein  35.12 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.485598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1952  hypothetical protein  30.39 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  0.0461591 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0686  hypothetical protein  36.25 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  28.44 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2449  hypothetical protein  26.71 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0089  hypothetical protein  23.2 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0669519  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  20.9 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  25.19 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>