29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1952 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1952  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  0.0461591 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1968  hypothetical protein  47.49 
 
 
239 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736708  hitchhiker  0.000925089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5545  hypothetical protein  32.37 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0158  hypothetical protein  30.57 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  30.4 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  29.31 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  29.31 
 
 
260 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  25.48 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3061  hypothetical protein  35.51 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.485598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  25.48 
 
 
244 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  25.16 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19980  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  34.31 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00940514  hitchhiker  0.00120115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  25.64 
 
 
244 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  25 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  25 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  25 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1691  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148884  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1760  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1714  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3437  hypothetical protein  28.8 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3489  hypothetical protein  28.8 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3426  hypothetical protein  28.8 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22330  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  28.22 
 
 
284 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0089  hypothetical protein  28.26 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0669519  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2449  hypothetical protein  25.15 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0686  hypothetical protein  30.87 
 
 
253 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>