28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0824 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  95.38 
 
 		 284 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  28.63 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  27.59 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  27.35 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  27.47 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  27.47 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  27.47 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  27.47 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  27.47 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  26.61 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  23.51 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1075  hypothetical protein  30.25 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1533  hypothetical protein  34.9 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.975829  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1952  hypothetical protein  29.31 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  0.0461591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3437  hypothetical protein  27.86 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3489  hypothetical protein  27.86 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3426  hypothetical protein  27.86 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5545  hypothetical protein  22.8 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22330  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  20.6 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0158  hypothetical protein  23.61 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1691  hypothetical protein  22.49 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0770  hypothetical protein  27.63 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000115194  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1760  hypothetical protein  22.49 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1714  hypothetical protein  22.49 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0089  hypothetical protein  30.53 
 
 		 225 aa  53.9  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0669519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1968  hypothetical protein  27.34 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736708  hitchhiker  0.000925089 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>