25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2449 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2449  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0198  hypothetical protein  29.46 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.485643  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4483  putative ABC transporter, permease protein  26.96 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0252052 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0711  hypothetical protein  26.81 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0963  putative ABC transporter, permease protein  26.43 
 
 
244 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0710  permease  26.52 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.251527  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0696  permease  25.99 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0891  ABC transporter, permease protein, putative  26.43 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.220032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22330  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR02206  28.82 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0761  ABC transporter permease  25.65 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0800  ABC transporter permease  25.65 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.93303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0895  putative ABC transporter, permease protein  25.65 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.41872e-39 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0853  putative ABC transporter, permease protein  26.09 
 
 
249 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0158  hypothetical protein  25.2 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3061  hypothetical protein  28.67 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.485598 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1968  hypothetical protein  26.79 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0736708  hitchhiker  0.000925089 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0686  hypothetical protein  27.43 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5545  hypothetical protein  25 
 
 
253 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.458717  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0812  hypothetical protein  23.05 
 
 
284 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000113907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3437  hypothetical protein  22.47 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3489  hypothetical protein  22.47 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.28663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3426  hypothetical protein  22.47 
 
 
245 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1952  hypothetical protein  25.95 
 
 
234 aa  45.4  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.523935  normal  0.0461591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0824  hypothetical protein  21.81 
 
 
260 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000195088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1691  hypothetical protein  22.6 
 
 
245 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>