13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11920 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11920  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1148  hypothetical protein  72.93 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0784  hypothetical protein  66.83 
 
 		 262 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4049  hypothetical protein  63.51 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.715703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2584  hypothetical protein  68.65 
 
 		 265 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3596  hypothetical protein  62.32 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3669  hypothetical protein  62.32 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3601  hypothetical protein  62.32 
 
 		 256 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1784  hypothetical protein  67.93 
 
 		 257 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000285856  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4196  hypothetical protein  66.12 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5535  hypothetical protein  57.36 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2212  hypothetical protein  41.67 
 
 		 177 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.960442  normal  0.272068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3946  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 428 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>