13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3946 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3946  putative CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 428 aa  859    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2558  hypothetical protein  48.78 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4177  hypothetical protein  47.24 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0508367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0690  hypothetical protein  46.73 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1297  hypothetical protein  37.54 
 
 		 451 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1787  hypothetical protein  48.62 
 
 		 255 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0808  hypothetical protein  32.85 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11920  hypothetical protein  30.58 
 
 		 264 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  33.59 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2861  hypothetical protein  37.66 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4049  hypothetical protein  28.16 
 
 		 271 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.715703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1784  hypothetical protein  28.97 
 
 		 257 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000285856  normal  0.0589875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>