14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1148 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1148  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  505  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11920  hypothetical protein  66.96 
 
 		 264 aa  293  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1784  hypothetical protein  70.49 
 
 		 257 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000285856  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4049  hypothetical protein  61.97 
 
 		 271 aa  255  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.715703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2584  hypothetical protein  63.85 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4196  hypothetical protein  65.46 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0784  hypothetical protein  64.1 
 
 		 262 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3596  hypothetical protein  59.81 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3669  hypothetical protein  59.81 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3601  hypothetical protein  59.81 
 
 		 256 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5535  hypothetical protein  54.09 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2212  hypothetical protein  43.14 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.960442  normal  0.272068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3946  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 428 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2558  hypothetical protein  26.96 
 
 		 428 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>