13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2212 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  350  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.960442  normal  0.272068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1784  hypothetical protein  48.89 
 
 		 257 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000285856  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5535  hypothetical protein  42.74 
 
 		 246 aa  81.3  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.249886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1148  hypothetical protein  42.86 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11920  hypothetical protein  39.82 
 
 		 264 aa  74.7  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.207254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4049  hypothetical protein  38 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835748  normal  0.715703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3596  hypothetical protein  37.37 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3669  hypothetical protein  37.37 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3601  hypothetical protein  37.37 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0784  hypothetical protein  41.86 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4196  hypothetical protein  39.36 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2584  hypothetical protein  40.26 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05800  hypothetical protein  31.67 
 
 		 115 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>