13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04780 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04780  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1067  hypothetical protein  27.88 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105525  hitchhiker  0.0000000418478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2719  hypothetical protein  28.62 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4340  hypothetical protein  30.33 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2908  hypothetical protein  26.79 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2361  hypothetical protein  29.78 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1735  hypothetical protein  30.3 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.787256 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1526  hypothetical protein  25.56 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2871  hypothetical protein  29.27 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56800  hypothetical protein  30.57 
 
 		 300 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2447  LemA family protein  26.15 
 
 		 437 aa  45.8  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0106  hypothetical protein  27.37 
 
 		 433 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00869017  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_117  LemA domain protein  26.94 
 
 		 434 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>