More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3024 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3024  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
255 aa  510  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662396  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3250  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  96.86 
 
 
255 aa  498  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  77.87 
 
 
254 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.68 
 
 
254 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.23 
 
 
260 aa  398  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.09 
 
 
259 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000252771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1842  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.15 
 
 
254 aa  371  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2302  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.96 
 
 
270 aa  364  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925959  hitchhiker  0.00103647 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2181  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.65 
 
 
255 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1894  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.09 
 
 
264 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0870843  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.26 
 
 
257 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.313635  decreased coverage  0.00565512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1165  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.24 
 
 
255 aa  360  1e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.26 
 
 
256 aa  358  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2302  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.63 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.8 
 
 
254 aa  353  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22330  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.47 
 
 
255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.025585  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1152  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.69 
 
 
255 aa  351  5.9999999999999994e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.345931 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21770  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  69.69 
 
 
256 aa  350  1e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13510  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.93 
 
 
260 aa  348  7e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.14 
 
 
258 aa  345  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.03 
 
 
255 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2321  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.38 
 
 
255 aa  342  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788907  normal  0.758579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4851  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.98 
 
 
254 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.83 
 
 
254 aa  331  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2572  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.67 
 
 
257 aa  322  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.58 
 
 
269 aa  297  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.58 
 
 
269 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2457  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.58 
 
 
269 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2502  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.58 
 
 
269 aa  296  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0853  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.14 
 
 
259 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3657  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.62 
 
 
268 aa  294  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2753  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.47 
 
 
269 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.86 
 
 
257 aa  279  3e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.541624  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4547  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.17 
 
 
255 aa  278  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0812385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4156  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.12 
 
 
264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2408  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  52.27 
 
 
280 aa  257  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2082  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  51.14 
 
 
279 aa  254  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.78 
 
 
256 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1635  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.93 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2502  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.93 
 
 
263 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  hitchhiker  0.00423136 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.15 
 
 
263 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0557222  normal  0.680475 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
260 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.657325 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1172  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.86 
 
 
264 aa  175  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00253599  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2130  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.85 
 
 
260 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1608  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0152673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3203  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2548  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.706352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2111  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1107  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.08 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1977  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39 
 
 
263 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240777  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1013  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.69 
 
 
264 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0613634  normal  0.0886164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  42.02 
 
 
259 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.98 
 
 
272 aa  167  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  37.98 
 
 
255 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.84 
 
 
274 aa  167  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.203215  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1935  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  39.45 
 
 
265 aa  165  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0125634  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.02 
 
 
260 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274334  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
265 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.55 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  41.09 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
264 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.537752  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.01 
 
 
274 aa  163  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0780  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.98 
 
 
273 aa  163  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.37 
 
 
273 aa  161  9e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.69 
 
 
260 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1821  hypothetical protein  37.98 
 
 
268 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1820  hypothetical protein  37.98 
 
 
268 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
265 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0638864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
258 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.62 
 
 
256 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
261 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18961  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.22 
 
 
274 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1045  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  39.06 
 
 
268 aa  159  3e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
256 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  40.7 
 
 
274 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.54 
 
 
256 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.486877  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.16 
 
 
274 aa  158  9e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0407  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  35.29 
 
 
255 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.369789  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
261 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
261 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
260 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1424  enoyl acyl carrier protein reductase  39.06 
 
 
268 aa  157  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
273 aa  157  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.16 
 
 
274 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  40.86 
 
 
286 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.16 
 
 
274 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
257 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.35 
 
 
263 aa  156  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.4 
 
 
292 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
255 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0307  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  37.4 
 
 
254 aa  156  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00919457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1672  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.31 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.106636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.89 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>