More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2105 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1894  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.36 
 
 
264 aa  348  6e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0870843  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3250  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.54 
 
 
255 aa  346  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3024  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.14 
 
 
255 aa  345  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662396  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.45 
 
 
257 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.313635  decreased coverage  0.00565512 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.78 
 
 
254 aa  335  5e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.78 
 
 
254 aa  334  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13510  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.17 
 
 
260 aa  332  5e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.39 
 
 
256 aa  330  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.35 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1842  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.81 
 
 
254 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1165  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.06 
 
 
255 aa  321  6e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.57 
 
 
255 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21770  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  61.72 
 
 
256 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2321  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.81 
 
 
255 aa  314  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788907  normal  0.758579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.24 
 
 
254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2302  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.77 
 
 
256 aa  308  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.69 
 
 
259 aa  307  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000252771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2572  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.61 
 
 
257 aa  307  9e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2181  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.57 
 
 
255 aa  307  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1152  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.45 
 
 
255 aa  305  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.345931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22330  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.63 
 
 
255 aa  300  1e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.025585  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2302  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.1 
 
 
270 aa  299  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925959  hitchhiker  0.00103647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0853  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.65 
 
 
259 aa  295  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.24 
 
 
254 aa  291  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4851  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.65 
 
 
254 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4547  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.2 
 
 
255 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0812385 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.95 
 
 
257 aa  268  5e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.541624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.52 
 
 
269 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2457  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.52 
 
 
269 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2502  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.52 
 
 
269 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.14 
 
 
269 aa  267  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209226 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3657  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.53 
 
 
268 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418184  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2753  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.53 
 
 
269 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2082  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  50.38 
 
 
279 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2408  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  51.53 
 
 
280 aa  258  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4156  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.76 
 
 
264 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
256 aa  215  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.89 
 
 
274 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.5 
 
 
274 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1977  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.31 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240777  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2130  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.17 
 
 
260 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1608  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0152673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2548  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.706352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3203  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2111  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520882  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2502  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.7 
 
 
263 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  hitchhiker  0.00423136 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.11 
 
 
274 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1635  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.7 
 
 
263 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0780  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.13 
 
 
273 aa  157  1e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.16 
 
 
263 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0557222  normal  0.680475 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
260 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.74 
 
 
274 aa  156  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1751  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.5 
 
 
273 aa  155  4e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0464231  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
261 aa  155  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
260 aa  154  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.657325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
261 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.715576  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
273 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1172  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.07 
 
 
264 aa  153  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00253599  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  35.25 
 
 
255 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
263 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.26 
 
 
260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274334  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.23 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
265 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  38.46 
 
 
259 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.5 
 
 
272 aa  151  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3255  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  37.02 
 
 
265 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1107  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.29 
 
 
264 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1013  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.68 
 
 
264 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0613634  normal  0.0886164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2419  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  36.88 
 
 
265 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0407  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  34.38 
 
 
255 aa  149  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.369789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.55 
 
 
273 aa  149  6e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  37.84 
 
 
259 aa  148  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
262 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1935  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  35.61 
 
 
265 aa  148  9e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0125634  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0638864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.12 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2178  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.61 
 
 
262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1045  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  34.63 
 
 
268 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.671499 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
257 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01265  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01276  hypothetical protein  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2337  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1401  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0944713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1925  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.043964  hitchhiker  0.0000000199206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  35.85 
 
 
274 aa  145  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1839  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.76 
 
 
262 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000277287 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
254 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0981  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  33.85 
 
 
254 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0601  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  34.77 
 
 
256 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.356019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0956  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  35.8 
 
 
282 aa  143  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138876  hitchhiker  0.00352928 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1424  enoyl acyl carrier protein reductase  34.24 
 
 
268 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.250038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  35.71 
 
 
275 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
265 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
265 aa  142  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.203215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>