22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2155 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  308  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  87.1 
 
 		 134 aa  166  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  61.54 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 		 292 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  57.85 
 
 		 132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  59.65 
 
 		 129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  43.71 
 
 		 287 aa  91.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  55.08 
 
 		 305 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  48.8 
 
 		 122 aa  84  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  50.41 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  55.45 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  47.76 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  37.8 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  36.77 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  41.18 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000940488  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  42.19 
 
 		 135 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  41.59 
 
 		 124 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  41.59 
 
 		 124 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3941  hypothetical protein  39.05 
 
 		 124 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00759865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1997  hypothetical protein  40.71 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>