23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12007 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000940488  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  71.43 
 
 
124 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1997  hypothetical protein  64.29 
 
 
124 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  63.49 
 
 
124 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  63.49 
 
 
124 aa  147  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3941  hypothetical protein  58.06 
 
 
124 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00759865  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  41.07 
 
 
129 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  35.23 
 
 
197 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  37.7 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  42.98 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  39.37 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  30.77 
 
 
183 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
292 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  34.82 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  40.18 
 
 
163 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 
305 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  35.09 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 
291 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1473  protein of unknown function DUF901  35.16 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3143  protein of unknown function DUF901  34.81 
 
 
471 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  58.06 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  30.89 
 
 
287 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>