22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0833 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0833  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  253  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.567086  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3635  hypothetical protein  53.85 
 
 
130 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1414  hypothetical protein  49.24 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234715  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3731  hypothetical protein  44.92 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.612226  normal  0.022429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
292 aa  70.1  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  40.6 
 
 
287 aa  68.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3265  hypothetical protein  44.03 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0757172  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2787  hypothetical protein  46.02 
 
 
129 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.502157  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2155  hypothetical protein  44.53 
 
 
163 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995978  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  43.17 
 
 
305 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2307  hypothetical protein  42.97 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 
335 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3499  hypothetical protein  35.62 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.555316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1244  hypothetical protein  42.39 
 
 
197 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.214862  decreased coverage  0.000603891 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6968  hypothetical protein  38.71 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.151467  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12007  hypothetical protein  35.65 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000940488  normal  0.526902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2002  hypothetical protein  32.74 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.549907 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2062  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2016  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1997  hypothetical protein  64.52 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3941  hypothetical protein  35.78 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00759865  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>