47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0477 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  947    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  43.94 
 
 		 458 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  35.89 
 
 		 467 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  36.33 
 
 		 472 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  34.91 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  32.22 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  35.12 
 
 		 481 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 483 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  31.14 
 
 		 487 aa  190  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  34.99 
 
 		 459 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  31.35 
 
 		 510 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  30.43 
 
 		 488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  30.53 
 
 		 470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  27.55 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  27.94 
 
 		 464 aa  140  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  28.95 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  28.6 
 
 		 454 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  27.2 
 
 		 459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  27.58 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  25.84 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  25.84 
 
 		 504 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  26.37 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  26.02 
 
 		 465 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  25.2 
 
 		 495 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  24.67 
 
 		 540 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  27.48 
 
 		 461 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  25.74 
 
 		 482 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  24.8 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  26.82 
 
 		 538 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  26.26 
 
 		 516 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  26.25 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  26.25 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  27.98 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  25.1 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  26.95 
 
 		 485 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  26.95 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  26.95 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  26.14 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  26.14 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  26.14 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  27.03 
 
 		 486 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  27.72 
 
 		 493 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  22.62 
 
 		 519 aa  70.1  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  25.58 
 
 		 480 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  27.86 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  25.48 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  31.52 
 
 		 482 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>