43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7885 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  100 
 
 		 465 aa  927    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  27.63 
 
 		 481 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  26.58 
 
 		 467 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  26.02 
 
 		 479 aa  96.7  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  26.97 
 
 		 488 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  29.81 
 
 		 459 aa  96.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  27.07 
 
 		 483 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  26.24 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  27.29 
 
 		 467 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  26.51 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  24.73 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  24.74 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  24.54 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  25.61 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  26.4 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  24.85 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  24.36 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  23.66 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  23.66 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  25.9 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  24.8 
 
 		 459 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  24.67 
 
 		 510 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  26.88 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  25.05 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  24.63 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  25.99 
 
 		 482 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  26.92 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  24.18 
 
 		 516 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  26.92 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  26.92 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  24.18 
 
 		 516 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  22.87 
 
 		 512 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  24.43 
 
 		 482 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  23.2 
 
 		 516 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  24.75 
 
 		 453 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  24.84 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  22 
 
 		 538 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  24.09 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  25.17 
 
 		 480 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  22.58 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  23.31 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  23.31 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  23.31 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>