43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3203 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  100 
 
 
459 aa  891    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  29.2 
 
 
448 aa  136  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  34.75 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  35.32 
 
 
464 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  33.43 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  29.34 
 
 
467 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  27.2 
 
 
479 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  30.85 
 
 
472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  29.17 
 
 
454 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  28.21 
 
 
488 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  27.16 
 
 
467 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  28.71 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  27.6 
 
 
453 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  28.54 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  32.59 
 
 
470 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  29.98 
 
 
481 aa  97.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  28.29 
 
 
487 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  26.95 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  32.27 
 
 
453 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  28.67 
 
 
461 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  30.89 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  27.13 
 
 
496 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  24.8 
 
 
465 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  36.31 
 
 
482 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  28.23 
 
 
505 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  25.96 
 
 
510 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  29.71 
 
 
540 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  25.48 
 
 
538 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  34.09 
 
 
519 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  32.37 
 
 
495 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  27.6 
 
 
506 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  33.88 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  33.88 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  33.88 
 
 
485 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  31.67 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  30.86 
 
 
516 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  26.17 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  24.24 
 
 
504 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  24.24 
 
 
504 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  50 
 
 
480 aa  44.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  29.66 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  29.66 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  32.1 
 
 
486 aa  43.5  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>