45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6576 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  100 
 
 		 540 aa  1083    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  39.12 
 
 		 519 aa  314  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  33.9 
 
 		 496 aa  214  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  32.05 
 
 		 461 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  28.89 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  31.29 
 
 		 457 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  31.29 
 
 		 457 aa  159  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  31.29 
 
 		 485 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  28.65 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  27.34 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  27.59 
 
 		 512 aa  146  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  28.08 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  28.49 
 
 		 491 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  28.49 
 
 		 491 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  28.49 
 
 		 491 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  27.85 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  27.85 
 
 		 504 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  30.25 
 
 		 453 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  28.07 
 
 		 538 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  27.55 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  27.58 
 
 		 495 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  28.3 
 
 		 488 aa  136  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  26.84 
 
 		 506 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  25.46 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  27.37 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  25 
 
 		 483 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  25.23 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  28.76 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  28.76 
 
 		 516 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  25.85 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  26.92 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  28.71 
 
 		 516 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  25.85 
 
 		 467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  27.34 
 
 		 453 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  25.29 
 
 		 458 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  25.78 
 
 		 472 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  25.05 
 
 		 479 aa  98.2  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  24.77 
 
 		 481 aa  94.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  26.35 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  24.26 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  23.18 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  24.1 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  29.71 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  23.73 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  30.34 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>