47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3295 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  100 
 
 
496 aa  972    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  41.31 
 
 
472 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  38.27 
 
 
461 aa  289  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  36.79 
 
 
510 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  40.17 
 
 
457 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  40.17 
 
 
457 aa  269  8e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  40.17 
 
 
485 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  36.45 
 
 
538 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  38.66 
 
 
516 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  38.46 
 
 
516 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  38.46 
 
 
516 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  36.29 
 
 
512 aa  262  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  36.14 
 
 
504 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  36.14 
 
 
504 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  37.98 
 
 
482 aa  261  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  34.08 
 
 
506 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  34.66 
 
 
505 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  35.5 
 
 
495 aa  243  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  34.96 
 
 
480 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  35.41 
 
 
493 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  34.9 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  34.9 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  34.9 
 
 
491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  34.01 
 
 
540 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  34.21 
 
 
486 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  34.75 
 
 
519 aa  226  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  34.69 
 
 
495 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  34.94 
 
 
453 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  30.58 
 
 
448 aa  150  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  28.95 
 
 
479 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  29.51 
 
 
467 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  30.06 
 
 
472 aa  127  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  28.74 
 
 
467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  29.48 
 
 
488 aa  121  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  28.49 
 
 
481 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  28.42 
 
 
458 aa  104  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  29.22 
 
 
483 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  27.67 
 
 
453 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  29.31 
 
 
454 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  29.21 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  29.11 
 
 
459 aa  94.4  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  28.9 
 
 
464 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  25 
 
 
487 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  24.32 
 
 
465 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  27.63 
 
 
459 aa  86.7  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  27.85 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  27.33 
 
 
482 aa  60.8  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>