29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1835 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  493  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  77.78 
 
 		 235 aa  388  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  80.18 
 
 		 234 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  82.98 
 
 		 234 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  69.17 
 
 		 246 aa  359  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  71.79 
 
 		 234 aa  358  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  68.75 
 
 		 246 aa  357  8e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  72.65 
 
 		 233 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  68.33 
 
 		 246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  68.33 
 
 		 246 aa  355  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  71.37 
 
 		 234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  71.37 
 
 		 234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  70.51 
 
 		 234 aa  353  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  72.53 
 
 		 232 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000381321  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  70.09 
 
 		 234 aa  349  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  62.98 
 
 		 241 aa  321  7e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  61.8 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  64.68 
 
 		 236 aa  308  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  60.7 
 
 		 235 aa  304  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  60.61 
 
 		 234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  63.25 
 
 		 234 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  59.23 
 
 		 235 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  60.94 
 
 		 234 aa  294  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  55.41 
 
 		 240 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  50.85 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  49.33 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  23.42 
 
 		 467 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  21.77 
 
 		 392 aa  42  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  22.71 
 
 		 199 aa  42  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>