26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2105 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  66.24 
 
 		 235 aa  324  7e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  66.52 
 
 		 234 aa  319  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  65.67 
 
 		 234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  63.95 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  64.81 
 
 		 234 aa  315  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  63.95 
 
 		 246 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  65.67 
 
 		 234 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  63.52 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  63.52 
 
 		 246 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  64.38 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  61.37 
 
 		 233 aa  304  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  64.41 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  61.21 
 
 		 232 aa  298  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000381321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  63.3 
 
 		 246 aa  294  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  55.36 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  59.66 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  62.66 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  59.63 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  57.33 
 
 		 234 aa  275  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  56.77 
 
 		 234 aa  271  7e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  53.6 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  47.64 
 
 		 236 aa  210  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  48.42 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>