26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1597 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1597  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.321672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2037  hypothetical protein  78.88 
 
 		 232 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000381321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1713  hypothetical protein  72.53 
 
 		 246 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0409323  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2484  hypothetical protein  73.39 
 
 		 234 aa  364  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00768413  normal  0.204356 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2576  hypothetical protein  73.39 
 
 		 234 aa  363  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000189024  normal  0.179906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1691  hypothetical protein  72.1 
 
 		 246 aa  363  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.666754  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1565  hypothetical protein  73.82 
 
 		 234 aa  362  2e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2414  hypothetical protein  72.96 
 
 		 234 aa  362  3e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00806149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2666  hypothetical protein  71.67 
 
 		 246 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0398844  normal  0.0175894 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1676  hypothetical protein  71.67 
 
 		 246 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0089383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2794  hypothetical protein  72.96 
 
 		 234 aa  359  2e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1601  hypothetical protein  69.66 
 
 		 235 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00766974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1505  hypothetical protein  71.62 
 
 		 234 aa  340  8e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250222  normal  0.876319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1835  hypothetical protein  72.65 
 
 		 246 aa  333  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2753  hypothetical protein  70.7 
 
 		 234 aa  321  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15175  normal  0.0221573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4969  hypothetical protein  66.97 
 
 		 236 aa  314  7e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.349038  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0530  hypothetical protein  61.8 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1227  hypothetical protein  62.34 
 
 		 234 aa  308  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3913  hypothetical protein  64.66 
 
 		 234 aa  305  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0241  hypothetical protein  61.8 
 
 		 241 aa  304  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2105  hypothetical protein  61.37 
 
 		 234 aa  294  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.796531 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07109  hypothetical protein  60.79 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001025  hypothetical protein  59.23 
 
 		 235 aa  293  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1445  hypothetical protein  56.76 
 
 		 240 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1017  hypothetical protein  49.57 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1501  hypothetical protein  50.91 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>