14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1338 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1338  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00752637  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3316  hypothetical protein  65.19 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.879917  hitchhiker  0.000321545 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2319  hypothetical protein  62.94 
 
 		 145 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2001  hypothetical protein  63.83 
 
 		 145 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1076  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1214  hypothetical protein  55.56 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000998214  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1233  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.100338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3242  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02474  hypothetical protein  42.97 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.438886  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0449  hypothetical protein  33.85 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3551  hypothetical protein  39.81 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0593  hypothetical protein  36.89 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3181  hypothetical protein  35.66 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3796  hypothetical protein  27.56 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>