13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3796 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3796  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  266  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1076  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3242  hypothetical protein  29.77 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0449  hypothetical protein  28.8 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3551  hypothetical protein  36.08 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3316  hypothetical protein  28.46 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.879917  hitchhiker  0.000321545 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02474  hypothetical protein  36.49 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.438886  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0593  hypothetical protein  34 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3181  hypothetical protein  27.93 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2001  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1338  hypothetical protein  27.56 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00752637  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2319  hypothetical protein  32.1 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1233  hypothetical protein  36.67 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.100338  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>