14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02474 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02474  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  4e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.438886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1076  hypothetical protein  43.94 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3316  hypothetical protein  42.52 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.879917  hitchhiker  0.000321545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1338  hypothetical protein  42.97 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00752637  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2319  hypothetical protein  43.31 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2001  hypothetical protein  40.94 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3242  hypothetical protein  37.59 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1233  hypothetical protein  43.41 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.100338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1214  hypothetical protein  42.64 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000998214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0449  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3551  hypothetical protein  33.86 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0593  hypothetical protein  32.58 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3181  hypothetical protein  31.36 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3796  hypothetical protein  32.2 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>