14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1233 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1233  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  327  3e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.100338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3316  hypothetical protein  50.78 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.879917  hitchhiker  0.000321545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1338  hypothetical protein  50.34 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00752637  normal  0.52847 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1214  hypothetical protein  57.38 
 
 		 138 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000998214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2001  hypothetical protein  53.68 
 
 		 145 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1076  hypothetical protein  41.91 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2319  hypothetical protein  52.27 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3242  hypothetical protein  38.76 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.069746  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02474  hypothetical protein  43.41 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.438886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3551  hypothetical protein  44.58 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0449  hypothetical protein  36.03 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0593  hypothetical protein  42.17 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3181  hypothetical protein  45.24 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3796  hypothetical protein  33.96 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>