18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0636 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0636  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.325359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4316  hypothetical protein  66.96 
 
 		 115 aa  163  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0463  hypothetical protein  58.26 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3698  hypothetical protein  54.39 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0419  hypothetical protein  42.74 
 
 		 115 aa  90.5  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000388405  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3425  hypothetical protein  39.32 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0636  hypothetical protein  39.13 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0527  hypothetical protein  41.53 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3596  hypothetical protein  39.32 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3759  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0581  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0575  hypothetical protein  37.61 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4035  hypothetical protein  40.17 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0551  hypothetical protein  37.39 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2112  hypothetical protein  31.3 
 
 		 115 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633086  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3663  hypothetical protein  32.48 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577615  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0500  hypothetical protein  33.96 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2270  hypothetical protein  27.52 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.280742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>