18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4035 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4035  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  239  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0527  hypothetical protein  91.23 
 
 		 122 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3425  hypothetical protein  90.35 
 
 		 122 aa  213  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3596  hypothetical protein  90.35 
 
 		 123 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0636  hypothetical protein  73.91 
 
 		 123 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0581  hypothetical protein  71.43 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0575  hypothetical protein  71.43 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3759  hypothetical protein  71.43 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0551  hypothetical protein  71.43 
 
 		 121 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3698  hypothetical protein  41.88 
 
 		 117 aa  87.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4316  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0463  hypothetical protein  39.32 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0636  hypothetical protein  42.37 
 
 		 117 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.325359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0500  hypothetical protein  41.9 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0419  hypothetical protein  33.93 
 
 		 115 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000388405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3663  hypothetical protein  31.86 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2112  hypothetical protein  35.65 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633086  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2270  hypothetical protein  28.04 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.280742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>