18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3596 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3596  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  247  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3425  hypothetical protein  93.44 
 
 
122 aa  234  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0527  hypothetical protein  94.17 
 
 
122 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4035  hypothetical protein  90.35 
 
 
119 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0636  hypothetical protein  72.03 
 
 
123 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0551  hypothetical protein  72.5 
 
 
121 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0581  hypothetical protein  72.5 
 
 
121 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0575  hypothetical protein  72.5 
 
 
121 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3759  hypothetical protein  72.5 
 
 
121 aa  167  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3698  hypothetical protein  41.03 
 
 
117 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0636  hypothetical protein  39.32 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.325359  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0463  hypothetical protein  38.02 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4316  hypothetical protein  38.26 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0500  hypothetical protein  43.81 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0419  hypothetical protein  34.82 
 
 
115 aa  72  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000388405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3663  hypothetical protein  30.77 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2112  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633086  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2270  hypothetical protein  28.04 
 
 
119 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.280742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>