18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0527 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0527  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  246  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3425  hypothetical protein  95.9 
 
 
122 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3596  hypothetical protein  94.17 
 
 
123 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4035  hypothetical protein  91.23 
 
 
119 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0636  hypothetical protein  69.17 
 
 
123 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0551  hypothetical protein  71.67 
 
 
121 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0581  hypothetical protein  71.67 
 
 
121 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0575  hypothetical protein  71.67 
 
 
121 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0735869 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3759  hypothetical protein  71.67 
 
 
121 aa  167  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3698  hypothetical protein  41.88 
 
 
117 aa  87.4  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4316  hypothetical protein  40 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0636  hypothetical protein  41.53 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.325359  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0463  hypothetical protein  37.19 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0419  hypothetical protein  35.71 
 
 
115 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000388405  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0500  hypothetical protein  42.86 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3663  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577615  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2112  hypothetical protein  35.65 
 
 
115 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633086  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2270  hypothetical protein  28.04 
 
 
119 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.280742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>