13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2270 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  238  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.280742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3698  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2112  hypothetical protein  32.41 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.633086  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0636  hypothetical protein  27.52 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.325359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4316  hypothetical protein  28.7 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3425  hypothetical protein  28.04 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0527  hypothetical protein  28.04 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0463  hypothetical protein  32.43 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3596  hypothetical protein  28.04 
 
 		 123 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4035  hypothetical protein  28.04 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0500  hypothetical protein  29.73 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0419  hypothetical protein  26.55 
 
 		 115 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000388405  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3663  hypothetical protein  25.47 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000577615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>