18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7717 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  548  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  66.55 
 
 
272 aa  359  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  64.66 
 
 
281 aa  342  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  43.06 
 
 
282 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  38.13 
 
 
279 aa  138  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  42.52 
 
 
261 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  34.5 
 
 
285 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  31.23 
 
 
258 aa  89  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  32.47 
 
 
217 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  30.84 
 
 
326 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  32.08 
 
 
259 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  34.15 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  27.15 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  32.89 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  27.07 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  33.75 
 
 
248 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4425  putative cytoplasmic protein  24.6 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  30.26 
 
 
235 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>