18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3673 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  507  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  33.83 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  38.63 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  38.15 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  34.69 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  32.82 
 
 		 281 aa  91.7  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  31.23 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  38.05 
 
 		 285 aa  68.6  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  26.7 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  26.9 
 
 		 326 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  31.53 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  30.86 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  32.41 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  30.63 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4425  putative cytoplasmic protein  28.09 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1641  hypothetical protein  28.41 
 
 		 188 aa  46.6  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  30 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>