14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2746 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  46.82 
 
 
282 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  42.05 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  38.13 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  37.12 
 
 
272 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  33.83 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  47.46 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  29.41 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  31.94 
 
 
217 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  34.07 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  29.71 
 
 
326 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  32.53 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  29.11 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  30.09 
 
 
259 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>