20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0382 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  40.97 
 
 
259 aa  134  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  40.15 
 
 
259 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  40.44 
 
 
245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  25.67 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  33.16 
 
 
285 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  30.1 
 
 
253 aa  92  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  28.72 
 
 
248 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  35.24 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  33.07 
 
 
272 aa  68.2  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  32.5 
 
 
281 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  32.47 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7283  hypothetical protein  34.74 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.316954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  35.37 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  26.7 
 
 
258 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4425  putative cytoplasmic protein  36.62 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  31.94 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4079  hypothetical protein  31.19 
 
 
304 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  29.91 
 
 
261 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>