16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4740 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  47.57 
 
 
279 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  42.35 
 
 
281 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  43.06 
 
 
275 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  40.07 
 
 
272 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  38.63 
 
 
258 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  39.67 
 
 
261 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  34.01 
 
 
285 aa  78.2  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  35.37 
 
 
217 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  34.69 
 
 
259 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  28.29 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  31.65 
 
 
253 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  33.73 
 
 
259 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  28.7 
 
 
259 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  31.31 
 
 
248 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  28.44 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>