18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4095 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4095  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  484  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2084  hypothetical protein  43.7 
 
 
281 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00272631  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1923  hypothetical protein  44.22 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109339  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7717  hypothetical protein  44.31 
 
 
275 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2746  hypothetical protein  41.8 
 
 
279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4740  hypothetical protein  42.74 
 
 
282 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0296125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3673  hypothetical protein  38.98 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.120891  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0306  hypothetical protein  36.75 
 
 
285 aa  99  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3866  hypothetical protein  37.27 
 
 
245 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158169  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1067  hypothetical protein  29.68 
 
 
259 aa  59.3  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3952  hypothetical protein  35.45 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0663928  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3809  hypothetical protein  34.55 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3568  hypothetical protein  28.1 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.896385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5847  hypothetical protein  31.48 
 
 
326 aa  56.2  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0382  hypothetical protein  29.91 
 
 
217 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0266  hypothetical protein  29.35 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.702144  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1641  hypothetical protein  31.65 
 
 
188 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2069  hypothetical protein  27.47 
 
 
235 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>