23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4003 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4003  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  612  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0330  hypothetical protein  56.81 
 
 		 301 aa  353  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1156  hypothetical protein  60.2 
 
 		 299 aa  351  8.999999999999999e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204231  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1263  hypothetical protein  60.2 
 
 		 310 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0119859  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3852  hypothetical protein  56.48 
 
 		 301 aa  350  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0330  conserved hypothetical protein  56.48 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03187  hypothetical protein  56.48 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3659  hypothetical protein  56.48 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03235  hypothetical protein  56.48 
 
 		 301 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3760  hypothetical protein  56.15 
 
 		 301 aa  348  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3578  hypothetical protein  56.15 
 
 		 301 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.881535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0447  DNA-binding protein  70.69 
 
 		 193 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0623501  hitchhiker  0.00000229479 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0363  hypothetical protein  40.13 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0173  hypothetical protein  35.28 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0043  hypothetical protein  31.7 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0859  hypothetical protein  30.16 
 
 		 307 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2135  regulatory protein GntR, HTH  43.08 
 
 		 121 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.696599  normal  0.323151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4061  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 121 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4290  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 133 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.518736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4136  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 133 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4569  regulatory protein GntR, HTH  43.4 
 
 		 121 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.631024  normal  0.320661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21200  transcriptional regulator, GntR family  43.64 
 
 		 120 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0814821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11176  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 121 aa  42.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>