16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0859 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0859  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0043  hypothetical protein  74.18 
 
 		 319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0173  hypothetical protein  34.74 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0363  hypothetical protein  27.87 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3852  hypothetical protein  31.15 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0330  hypothetical protein  31.15 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224288 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03235  hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0330  conserved hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03187  hypothetical protein  30.82 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3659  hypothetical protein  30.49 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3578  hypothetical protein  30.49 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.881535  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3760  hypothetical protein  30.49 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4003  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1263  hypothetical protein  27.95 
 
 		 310 aa  99.8  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0119859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1156  hypothetical protein  27.96 
 
 		 299 aa  99.8  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204231  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0447  DNA-binding protein  30.23 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0623501  hitchhiker  0.00000229479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>