17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1263 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1263  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0119859  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1156  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4003  GntR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 299 aa  360  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0447  DNA-binding protein  100 
 
 		 193 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0623501  hitchhiker  0.00000229479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0330  hypothetical protein  52.82 
 
 		 301 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.224288 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0330  conserved hypothetical protein  52.82 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03187  hypothetical protein  52.82 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03235  hypothetical protein  52.82 
 
 		 301 aa  332  3e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3852  hypothetical protein  52.82 
 
 		 301 aa  332  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.485796  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3578  hypothetical protein  52.49 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.881535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3659  hypothetical protein  52.49 
 
 		 301 aa  329  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3760  hypothetical protein  52.16 
 
 		 301 aa  328  9e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0363  hypothetical protein  37.54 
 
 		 303 aa  195  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0173  hypothetical protein  33.12 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0043  hypothetical protein  29.32 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0859  hypothetical protein  27.78 
 
 		 307 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2355  transcriptional regulator, GntR family  52.17 
 
 		 128 aa  43.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>