21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3681 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3681  phospholipase A(1)  100 
 
 
320 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0179206  normal  0.113724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1123  lipase family protein  57.76 
 
 
320 aa  328  8e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.81089  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1175  phospholipase A(1)  57.14 
 
 
320 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3597  phospholipase A  57.14 
 
 
320 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2512  PAAR repeat-containing protein  29.46 
 
 
461 aa  86.7  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3237  PAAR repeat-containing protein  31.6 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2824  PAAR repeat-containing protein  32.29 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2303  hypothetical protein  35.08 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.457851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4079  hypothetical protein  29.46 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1213  hypothetical protein  29.79 
 
 
368 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7559  phospholipase A1  30.65 
 
 
460 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3037  hypothetical protein  28.82 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  28.72 
 
 
430 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2719  hemolysin-type calcium-binding protein  39.78 
 
 
796 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  41.94 
 
 
3026 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1197  hypothetical protein  29.86 
 
 
462 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0002  hypothetical protein  29.79 
 
 
239 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  29.17 
 
 
928 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0817  hypothetical protein  38.64 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000194581 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29272  predicted protein  33.08 
 
 
550 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1960  hypothetical protein  26.36 
 
 
204 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>